Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX6O95503 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX6O95503 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX6O95503 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX6O95503 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX6O95503 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX6O95503 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX6O95503 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX6O95503 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX6O95503 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX6O95503 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX6O95503 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX6O95503 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX6O95503 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX6O95503 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX6O95503 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX6O95503 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX6O95503 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX6O95503 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX6O95503 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX6O95503 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX6O95503 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX6O95503 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX6O95503 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX6O95503 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX6O95503 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX6O95503 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX6O95503 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX6O95503 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX6O95503 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX6O95503 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX6O95503 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX6O95503 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX6O95503 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX6O95503 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX6O95503 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX6O95503 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX6O95503 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX6O95503 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX6O95503 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX6O95503 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX6O95503 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX6O95503 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX6O95503 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX6O95503 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX6O95503 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX6O95503 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX6O95503 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX6O95503 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX6O95503 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX6O95503 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX6O95503 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX6O95503 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX6O95503 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX6O95503 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX6O95503 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX6O95503 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX6O95503 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX6O95503 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX6O95503 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX6O95503 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX6O95503 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX6O95503 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX6O95503 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX6O95503 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX6O95503 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX6O95503 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX6O95503 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX6O95503 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX6O95503 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX6O95503 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX6O95503 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX6O95503 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX6O95503 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX6O95503 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX6O95503 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX6O95503 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX6O95503 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX6O95503 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX6O95503 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX6O95503 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX6O95503 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX6O95503 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX6O95503 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX6O95503 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX6O95503 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX6O95503 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX6O95503 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX6O95503 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX6O95503 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX6O95503 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX6O95503 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX6O95503 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX6O95503 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX6O95503 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX6O95503 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX6O95503 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX6O95503 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX6O95503 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX6O95503 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms