Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEBLO76041 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEBLO76041 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEBLO76041 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEBLO76041 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEBLO76041 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEBLO76041 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEBLO76041 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEBLO76041 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEBLO76041 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEBLO76041 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEBLO76041 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEBLO76041 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEBLO76041 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEBLO76041 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEBLO76041 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEBLO76041 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEBLO76041 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEBLO76041 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NEBLO76041 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEBLO76041 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEBLO76041 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEBLO76041 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEBLO76041 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEBLO76041 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEBLO76041 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEBLO76041 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEBLO76041 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEBLO76041 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEBLO76041 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEBLO76041 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEBLO76041 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEBLO76041 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEBLO76041 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEBLO76041 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEBLO76041 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEBLO76041 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEBLO76041 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEBLO76041 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEBLO76041 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEBLO76041 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEBLO76041 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEBLO76041 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEBLO76041 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEBLO76041 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEBLO76041 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEBLO76041 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEBLO76041 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEBLO76041 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEBLO76041 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEBLO76041 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEBLO76041 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEBLO76041 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEBLO76041 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEBLO76041 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEBLO76041 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NEBLO76041 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEBLO76041 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEBLO76041 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEBLO76041 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEBLO76041 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEBLO76041 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEBLO76041 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEBLO76041 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEBLO76041 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEBLO76041 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEBLO76041 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEBLO76041 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEBLO76041 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEBLO76041 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEBLO76041 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEBLO76041 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEBLO76041 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NEBLO76041 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEBLO76041 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEBLO76041 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEBLO76041 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEBLO76041 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEBLO76041 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEBLO76041 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEBLO76041 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEBLO76041 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEBLO76041 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEBLO76041 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEBLO76041 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEBLO76041 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEBLO76041 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEBLO76041 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEBLO76041 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEBLO76041 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEBLO76041 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEBLO76041 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEBLO76041 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEBLO76041 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEBLO76041 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEBLO76041 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEBLO76041 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEBLO76041 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEBLO76041 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEBLO76041 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms