Protein–RNA interactions for Protein: O75581

LRP6, Low-density lipoprotein receptor-related protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP6O75581 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LRP6O75581 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRP6O75581 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRP6O75581 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRP6O75581 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRP6O75581 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRP6O75581 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRP6O75581 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP6O75581 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP6O75581 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP6O75581 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP6O75581 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP6O75581 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP6O75581 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP6O75581 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP6O75581 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP6O75581 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP6O75581 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP6O75581 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP6O75581 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP6O75581 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP6O75581 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP6O75581 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP6O75581 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP6O75581 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP6O75581 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP6O75581 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRP6O75581 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRP6O75581 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRP6O75581 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRP6O75581 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRP6O75581 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRP6O75581 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LRP6O75581 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRP6O75581 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRP6O75581 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LRP6O75581 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRP6O75581 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRP6O75581 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRP6O75581 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRP6O75581 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRP6O75581 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRP6O75581 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRP6O75581 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRP6O75581 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LRP6O75581 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRP6O75581 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRP6O75581 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LRP6O75581 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRP6O75581 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRP6O75581 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRP6O75581 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRP6O75581 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRP6O75581 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRP6O75581 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LRP6O75581 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRP6O75581 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRP6O75581 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LRP6O75581 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
LRP6O75581 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LRP6O75581 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRP6O75581 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRP6O75581 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LRP6O75581 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRP6O75581 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRP6O75581 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LRP6O75581 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LRP6O75581 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRP6O75581 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRP6O75581 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRP6O75581 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRP6O75581 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRP6O75581 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRP6O75581 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRP6O75581 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRP6O75581 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRP6O75581 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LRP6O75581 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRP6O75581 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRP6O75581 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRP6O75581 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRP6O75581 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LRP6O75581 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRP6O75581 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRP6O75581 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRP6O75581 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRP6O75581 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRP6O75581 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRP6O75581 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRP6O75581 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRP6O75581 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRP6O75581 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRP6O75581 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRP6O75581 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRP6O75581 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRP6O75581 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRP6O75581 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRP6O75581 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRP6O75581 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRP6O75581 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms