Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX3O75364 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX3O75364 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX3O75364 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX3O75364 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX3O75364 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITX3O75364 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITX3O75364 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITX3O75364 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITX3O75364 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITX3O75364 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX3O75364 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX3O75364 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX3O75364 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX3O75364 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX3O75364 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX3O75364 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX3O75364 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX3O75364 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX3O75364 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX3O75364 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX3O75364 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX3O75364 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX3O75364 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX3O75364 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX3O75364 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX3O75364 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX3O75364 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX3O75364 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX3O75364 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX3O75364 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX3O75364 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX3O75364 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX3O75364 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITX3O75364 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX3O75364 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX3O75364 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX3O75364 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX3O75364 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX3O75364 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX3O75364 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX3O75364 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX3O75364 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX3O75364 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX3O75364 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX3O75364 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX3O75364 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX3O75364 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX3O75364 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX3O75364 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITX3O75364 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX3O75364 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX3O75364 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX3O75364 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX3O75364 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX3O75364 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX3O75364 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX3O75364 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX3O75364 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX3O75364 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX3O75364 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX3O75364 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX3O75364 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX3O75364 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX3O75364 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX3O75364 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX3O75364 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX3O75364 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX3O75364 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX3O75364 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX3O75364 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX3O75364 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX3O75364 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX3O75364 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX3O75364 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX3O75364 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX3O75364 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PITX3O75364 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX3O75364 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX3O75364 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX3O75364 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX3O75364 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX3O75364 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX3O75364 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX3O75364 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX3O75364 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX3O75364 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX3O75364 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX3O75364 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX3O75364 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX3O75364 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX3O75364 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX3O75364 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX3O75364 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX3O75364 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX3O75364 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PITX3O75364 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX3O75364 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX3O75364 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PITX3O75364 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms