Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms