Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBNO60934 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBNO60934 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBNO60934 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBNO60934 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBNO60934 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBNO60934 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBNO60934 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBNO60934 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NBNO60934 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBNO60934 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBNO60934 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBNO60934 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NBNO60934 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NBNO60934 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NBNO60934 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBNO60934 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBNO60934 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBNO60934 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBNO60934 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBNO60934 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBNO60934 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBNO60934 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBNO60934 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBNO60934 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBNO60934 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBNO60934 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBNO60934 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBNO60934 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBNO60934 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBNO60934 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBNO60934 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBNO60934 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBNO60934 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBNO60934 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBNO60934 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBNO60934 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBNO60934 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBNO60934 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBNO60934 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBNO60934 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBNO60934 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBNO60934 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBNO60934 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBNO60934 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBNO60934 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBNO60934 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBNO60934 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBNO60934 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBNO60934 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBNO60934 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBNO60934 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBNO60934 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBNO60934 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBNO60934 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBNO60934 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBNO60934 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NBNO60934 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBNO60934 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBNO60934 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBNO60934 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBNO60934 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NBNO60934 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBNO60934 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBNO60934 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBNO60934 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBNO60934 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBNO60934 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBNO60934 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBNO60934 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBNO60934 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NBNO60934 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NBNO60934 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NBNO60934 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBNO60934 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBNO60934 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBNO60934 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBNO60934 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBNO60934 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBNO60934 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NBNO60934 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBNO60934 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBNO60934 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBNO60934 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NBNO60934 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBNO60934 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBNO60934 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBNO60934 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBNO60934 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBNO60934 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBNO60934 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBNO60934 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBNO60934 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBNO60934 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBNO60934 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBNO60934 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBNO60934 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBNO60934 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBNO60934 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NBNO60934 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms