Protein–RNA interactions for Protein: O60504

SORBS3, Vinexin, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3O60504 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SORBS3O60504 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SORBS3O60504 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SORBS3O60504 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SORBS3O60504 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SORBS3O60504 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SORBS3O60504 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms