Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIN3BO60391 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIN3BO60391 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN3BO60391 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN3BO60391 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN3BO60391 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN3BO60391 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN3BO60391 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN3BO60391 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN3BO60391 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN3BO60391 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN3BO60391 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN3BO60391 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN3BO60391 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN3BO60391 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN3BO60391 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN3BO60391 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN3BO60391 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN3BO60391 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN3BO60391 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN3BO60391 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN3BO60391 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms