Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOX15O60248 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOX15O60248 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOX15O60248 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOX15O60248 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOX15O60248 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOX15O60248 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOX15O60248 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOX15O60248 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOX15O60248 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SOX15O60248 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOX15O60248 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOX15O60248 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOX15O60248 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOX15O60248 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOX15O60248 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOX15O60248 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOX15O60248 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SOX15O60248 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOX15O60248 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOX15O60248 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOX15O60248 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOX15O60248 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOX15O60248 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOX15O60248 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SOX15O60248 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOX15O60248 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOX15O60248 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOX15O60248 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SOX15O60248 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOX15O60248 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOX15O60248 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOX15O60248 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOX15O60248 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOX15O60248 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOX15O60248 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOX15O60248 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOX15O60248 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOX15O60248 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOX15O60248 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOX15O60248 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOX15O60248 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOX15O60248 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOX15O60248 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SOX15O60248 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOX15O60248 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOX15O60248 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOX15O60248 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOX15O60248 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOX15O60248 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOX15O60248 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOX15O60248 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOX15O60248 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOX15O60248 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOX15O60248 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOX15O60248 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOX15O60248 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOX15O60248 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOX15O60248 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOX15O60248 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOX15O60248 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOX15O60248 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SOX15O60248 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOX15O60248 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOX15O60248 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOX15O60248 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOX15O60248 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOX15O60248 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOX15O60248 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOX15O60248 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOX15O60248 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOX15O60248 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOX15O60248 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOX15O60248 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SOX15O60248 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOX15O60248 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOX15O60248 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SOX15O60248 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOX15O60248 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SOX15O60248 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOX15O60248 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOX15O60248 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOX15O60248 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOX15O60248 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOX15O60248 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOX15O60248 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOX15O60248 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOX15O60248 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOX15O60248 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOX15O60248 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SOX15O60248 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOX15O60248 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOX15O60248 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOX15O60248 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOX15O60248 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOX15O60248 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOX15O60248 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOX15O60248 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOX15O60248 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOX15O60248 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms