Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXCL13O43927 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms