Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXTL3O43909 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms