Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP9BO43861 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP9BO43861 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP9BO43861 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP9BO43861 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP9BO43861 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP9BO43861 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP9BO43861 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP9BO43861 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP9BO43861 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP9BO43861 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP9BO43861 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP9BO43861 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP9BO43861 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP9BO43861 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP9BO43861 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP9BO43861 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP9BO43861 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP9BO43861 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP9BO43861 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP9BO43861 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP9BO43861 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP9BO43861 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP9BO43861 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP9BO43861 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP9BO43861 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP9BO43861 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP9BO43861 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP9BO43861 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP9BO43861 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP9BO43861 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP9BO43861 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP9BO43861 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP9BO43861 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP9BO43861 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP9BO43861 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP9BO43861 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP9BO43861 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP9BO43861 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP9BO43861 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP9BO43861 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP9BO43861 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP9BO43861 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP9BO43861 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP9BO43861 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP9BO43861 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP9BO43861 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP9BO43861 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP9BO43861 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP9BO43861 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP9BO43861 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP9BO43861 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP9BO43861 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP9BO43861 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP9BO43861 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP9BO43861 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP9BO43861 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP9BO43861 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP9BO43861 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP9BO43861 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP9BO43861 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP9BO43861 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP9BO43861 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP9BO43861 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP9BO43861 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP9BO43861 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP9BO43861 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP9BO43861 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP9BO43861 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP9BO43861 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP9BO43861 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP9BO43861 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP9BO43861 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP9BO43861 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP9BO43861 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP9BO43861 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP9BO43861 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP9BO43861 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP9BO43861 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP9BO43861 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP9BO43861 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP9BO43861 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP9BO43861 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP9BO43861 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP9BO43861 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP9BO43861 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP9BO43861 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP9BO43861 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP9BO43861 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP9BO43861 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP9BO43861 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP9BO43861 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP9BO43861 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP9BO43861 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP9BO43861 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP9BO43861 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP9BO43861 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP9BO43861 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms