Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRNO43815 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRNO43815 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRNO43815 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRNO43815 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRNO43815 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
STRNO43815 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRNO43815 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRNO43815 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRNO43815 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRNO43815 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRNO43815 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRNO43815 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRNO43815 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRNO43815 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRNO43815 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRNO43815 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRNO43815 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRNO43815 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRNO43815 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRNO43815 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRNO43815 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRNO43815 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRNO43815 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
STRNO43815 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRNO43815 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRNO43815 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRNO43815 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRNO43815 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRNO43815 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRNO43815 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
STRNO43815 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRNO43815 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRNO43815 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRNO43815 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
STRNO43815 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
STRNO43815 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
STRNO43815 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
STRNO43815 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRNO43815 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRNO43815 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRNO43815 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRNO43815 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRNO43815 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRNO43815 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRNO43815 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
STRNO43815 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRNO43815 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRNO43815 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRNO43815 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
STRNO43815 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRNO43815 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRNO43815 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRNO43815 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRNO43815 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRNO43815 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRNO43815 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRNO43815 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRNO43815 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRNO43815 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRNO43815 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRNO43815 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRNO43815 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRNO43815 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRNO43815 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRNO43815 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRNO43815 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
STRNO43815 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRNO43815 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRNO43815 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
STRNO43815 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRNO43815 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRNO43815 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRNO43815 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRNO43815 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRNO43815 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRNO43815 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRNO43815 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRNO43815 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRNO43815 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRNO43815 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRNO43815 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STRNO43815 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRNO43815 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRNO43815 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRNO43815 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STRNO43815 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRNO43815 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRNO43815 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRNO43815 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRNO43815 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRNO43815 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRNO43815 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRNO43815 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
STRNO43815 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRNO43815 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRNO43815 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRNO43815 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
STRNO43815 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
STRNO43815 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms