Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYNGR2O43760 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms