Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRC1O43663 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRC1O43663 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRC1O43663 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRC1O43663 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRC1O43663 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRC1O43663 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRC1O43663 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRC1O43663 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRC1O43663 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRC1O43663 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRC1O43663 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRC1O43663 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRC1O43663 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRC1O43663 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRC1O43663 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRC1O43663 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRC1O43663 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRC1O43663 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRC1O43663 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRC1O43663 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRC1O43663 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRC1O43663 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRC1O43663 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRC1O43663 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRC1O43663 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRC1O43663 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRC1O43663 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRC1O43663 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRC1O43663 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRC1O43663 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRC1O43663 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRC1O43663 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRC1O43663 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRC1O43663 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRC1O43663 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRC1O43663 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRC1O43663 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRC1O43663 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRC1O43663 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRC1O43663 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRC1O43663 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRC1O43663 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRC1O43663 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRC1O43663 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRC1O43663 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRC1O43663 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRC1O43663 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRC1O43663 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRC1O43663 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRC1O43663 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRC1O43663 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRC1O43663 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRC1O43663 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRC1O43663 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRC1O43663 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRC1O43663 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRC1O43663 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRC1O43663 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRC1O43663 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRC1O43663 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRC1O43663 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRC1O43663 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRC1O43663 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRC1O43663 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRC1O43663 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRC1O43663 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRC1O43663 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRC1O43663 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRC1O43663 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRC1O43663 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRC1O43663 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRC1O43663 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRC1O43663 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRC1O43663 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRC1O43663 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRC1O43663 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRC1O43663 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRC1O43663 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRC1O43663 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRC1O43663 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRC1O43663 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRC1O43663 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRC1O43663 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRC1O43663 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRC1O43663 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRC1O43663 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRC1O43663 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRC1O43663 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRC1O43663 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRC1O43663 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRC1O43663 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRC1O43663 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRC1O43663 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRC1O43663 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRC1O43663 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRC1O43663 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRC1O43663 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRC1O43663 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRC1O43663 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms