Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HTRA2O43464 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HTRA2O43464 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HTRA2O43464 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HTRA2O43464 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HTRA2O43464 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HTRA2O43464 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HTRA2O43464 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HTRA2O43464 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HTRA2O43464 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HTRA2O43464 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HTRA2O43464 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HTRA2O43464 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HTRA2O43464 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HTRA2O43464 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HTRA2O43464 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms