Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTIFO43310 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTIFO43310 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTIFO43310 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTIFO43310 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CTIFO43310 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTIFO43310 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTIFO43310 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTIFO43310 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTIFO43310 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTIFO43310 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTIFO43310 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTIFO43310 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTIFO43310 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTIFO43310 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTIFO43310 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTIFO43310 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTIFO43310 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTIFO43310 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTIFO43310 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTIFO43310 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTIFO43310 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTIFO43310 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTIFO43310 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTIFO43310 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTIFO43310 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTIFO43310 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTIFO43310 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTIFO43310 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTIFO43310 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTIFO43310 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTIFO43310 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTIFO43310 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTIFO43310 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTIFO43310 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTIFO43310 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTIFO43310 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTIFO43310 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTIFO43310 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTIFO43310 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTIFO43310 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTIFO43310 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTIFO43310 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTIFO43310 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTIFO43310 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTIFO43310 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTIFO43310 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTIFO43310 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTIFO43310 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTIFO43310 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTIFO43310 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTIFO43310 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTIFO43310 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTIFO43310 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTIFO43310 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTIFO43310 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTIFO43310 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTIFO43310 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTIFO43310 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTIFO43310 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTIFO43310 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTIFO43310 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTIFO43310 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTIFO43310 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTIFO43310 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTIFO43310 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTIFO43310 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTIFO43310 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTIFO43310 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTIFO43310 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTIFO43310 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTIFO43310 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTIFO43310 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTIFO43310 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTIFO43310 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTIFO43310 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTIFO43310 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTIFO43310 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTIFO43310 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTIFO43310 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTIFO43310 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTIFO43310 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTIFO43310 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CTIFO43310 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTIFO43310 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTIFO43310 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTIFO43310 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTIFO43310 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTIFO43310 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTIFO43310 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTIFO43310 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTIFO43310 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTIFO43310 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTIFO43310 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTIFO43310 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTIFO43310 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTIFO43310 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTIFO43310 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTIFO43310 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTIFO43310 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
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