Protein–RNA interactions for Protein: O14983

ATP2A1, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A1O14983 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP2A1O14983 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2A1O14983 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms