Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms