Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF6O14896 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF6O14896 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF6O14896 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF6O14896 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF6O14896 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF6O14896 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF6O14896 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF6O14896 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF6O14896 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF6O14896 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF6O14896 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF6O14896 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF6O14896 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF6O14896 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF6O14896 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF6O14896 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF6O14896 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF6O14896 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF6O14896 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF6O14896 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF6O14896 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF6O14896 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF6O14896 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF6O14896 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF6O14896 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF6O14896 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF6O14896 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF6O14896 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF6O14896 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF6O14896 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF6O14896 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF6O14896 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF6O14896 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF6O14896 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF6O14896 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF6O14896 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF6O14896 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF6O14896 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF6O14896 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF6O14896 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF6O14896 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF6O14896 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF6O14896 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF6O14896 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF6O14896 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF6O14896 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF6O14896 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF6O14896 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF6O14896 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF6O14896 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF6O14896 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF6O14896 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF6O14896 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF6O14896 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF6O14896 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF6O14896 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF6O14896 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF6O14896 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF6O14896 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF6O14896 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF6O14896 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF6O14896 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF6O14896 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF6O14896 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF6O14896 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF6O14896 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF6O14896 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF6O14896 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF6O14896 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF6O14896 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF6O14896 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF6O14896 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF6O14896 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF6O14896 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF6O14896 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF6O14896 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF6O14896 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF6O14896 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF6O14896 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF6O14896 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF6O14896 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF6O14896 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF6O14896 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF6O14896 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF6O14896 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF6O14896 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF6O14896 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF6O14896 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRF6O14896 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IRF6O14896 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IRF6O14896 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRF6O14896 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRF6O14896 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24■■□□□ 1.43
IRF6O14896 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IRF6O14896 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRF6O14896 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRF6O14896 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IRF6O14896 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IRF6O14896 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms