Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CITO14578 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CITO14578 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CITO14578 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CITO14578 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CITO14578 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CITO14578 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CITO14578 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CITO14578 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CITO14578 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CITO14578 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CITO14578 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CITO14578 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CITO14578 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CITO14578 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CITO14578 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CITO14578 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CITO14578 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CITO14578 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CITO14578 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CITO14578 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CITO14578 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CITO14578 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CITO14578 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CITO14578 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CITO14578 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CITO14578 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CITO14578 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CITO14578 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CITO14578 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CITO14578 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CITO14578 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CITO14578 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CITO14578 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CITO14578 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CITO14578 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CITO14578 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CITO14578 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CITO14578 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CITO14578 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CITO14578 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CITO14578 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CITO14578 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CITO14578 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CITO14578 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CITO14578 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CITO14578 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CITO14578 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CITO14578 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CITO14578 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CITO14578 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CITO14578 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CITO14578 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CITO14578 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CITO14578 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CITO14578 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CITO14578 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CITO14578 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CITO14578 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CITO14578 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CITO14578 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CITO14578 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CITO14578 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CITO14578 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CITO14578 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CITO14578 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CITO14578 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CITO14578 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CITO14578 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CITO14578 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CITO14578 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CITO14578 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CITO14578 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CITO14578 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CITO14578 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CITO14578 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CITO14578 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CITO14578 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CITO14578 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CITO14578 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CITO14578 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CITO14578 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CITO14578 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CITO14578 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CITO14578 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CITO14578 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CITO14578 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CITO14578 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CITO14578 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CITO14578 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CITO14578 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CITO14578 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CITO14578 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CITO14578 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CITO14578 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CITO14578 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CITO14578 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CITO14578 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CITO14578 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CITO14578 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms