Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOCS3O14543 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms