Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms