Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKBIEO00221 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms