Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
J3KT08 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
J3KT08 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
J3KT08 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
J3KT08 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
J3KT08 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
J3KT08 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
J3KT08 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
J3KT08 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
J3KT08 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
J3KT08 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
J3KT08 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
J3KT08 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
J3KT08 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
J3KT08 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
J3KT08 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
J3KT08 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
J3KT08 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
J3KT08 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
J3KT08 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
J3KT08 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
J3KT08 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
J3KT08 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
J3KT08 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
J3KT08 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
J3KT08 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
J3KT08 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
J3KT08 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
J3KT08 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
J3KT08 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
J3KT08 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
J3KT08 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
J3KT08 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
J3KT08 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
J3KT08 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
J3KT08 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
J3KT08 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
J3KT08 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
J3KT08 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
J3KT08 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
J3KT08 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
J3KT08 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
J3KT08 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
J3KT08 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
J3KT08 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
J3KT08 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
J3KT08 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
J3KT08 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
J3KT08 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
J3KT08 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
J3KT08 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
J3KT08 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
J3KT08 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
J3KT08 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
J3KT08 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
J3KT08 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
J3KT08 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
J3KT08 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
J3KT08 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
J3KT08 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
J3KT08 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
J3KT08 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
J3KT08 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
J3KT08 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
J3KT08 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
J3KT08 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms