Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1W4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1W4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1W4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1W4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1W4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1W4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1W4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1W4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1W4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1W4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1W4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1W4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1W4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1W4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1W4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1W4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1W4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1W4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1W4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1W4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1W4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1W4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H7C1W4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
H7C1W4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
H7C1W4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
H7C1W4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
H7C1W4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
H7C1W4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H7C1W4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
H7C1W4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H7C1W4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H7C1W4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
H7C1W4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
H7C1W4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
H7C1W4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H7C1W4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
H7C1W4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H7C1W4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H7C1W4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H7C1W4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H7C1W4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H7C1W4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H7C1W4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H7C1W4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H7C1W4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H7C1W4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H7C1W4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H7C1W4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H7C1W4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
H7C1W4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
H7C1W4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H7C1W4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
H7C1W4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
H7C1W4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
H7C1W4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
H7C1W4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H7C1W4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H7C1W4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H7C1W4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H7C1W4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
H7C1W4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
H7C1W4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H7C1W4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H7C1W4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
H7C1W4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
H7C1W4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
H7C1W4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
H7C1W4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H7C1W4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
H7C1W4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
H7C1W4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
H7C1W4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H7C1W4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
H7C1W4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H7C1W4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H7C1W4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
H7C1W4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
H7C1W4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
H7C1W4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
H7C1W4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
H7C1W4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H7C1W4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H7C1W4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H7C1W4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
H7C1W4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
H7C1W4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H7C1W4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H7C1W4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
H7C1W4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
H7C1W4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H7C1W4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
H7C1W4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H7C1W4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H7C1W4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H7C1W4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H7C1W4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H7C1W4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H7C1W4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H7C1W4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms