Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DGG1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DGG1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DGG1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DGG1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DGG1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DGG1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DGG1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DGG1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DGG1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DGG1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DGG1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DGG1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DGG1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DGG1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DGG1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DGG1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DGG1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DGG1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DGG1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DGG1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DGG1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DGG1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DGG1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DGG1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DGG1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DGG1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DGG1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DGG1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
B4DGG1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
B4DGG1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
B4DGG1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
B4DGG1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
B4DGG1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
B4DGG1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
B4DGG1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DGG1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DGG1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DGG1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DGG1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DGG1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DGG1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DGG1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DGG1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DGG1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DGG1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DGG1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DGG1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DGG1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DGG1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DGG1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DGG1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DGG1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DGG1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DGG1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DGG1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DGG1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DGG1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DGG1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DGG1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DGG1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DGG1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DGG1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DGG1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DGG1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DGG1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DGG1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DGG1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DGG1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DGG1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DGG1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DGG1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DGG1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DGG1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DGG1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DGG1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DGG1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DGG1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DGG1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DGG1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DGG1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DGG1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DGG1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DGG1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DGG1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DGG1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DGG1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
B4DGG1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DGG1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DGG1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DGG1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DGG1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DGG1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DGG1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DGG1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DGG1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DGG1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DGG1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DGG1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
B4DGG1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms