Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms