Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L5A8MUK1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L5A8MUK1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms