Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C5orf51A6NDU8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms