Protein–RNA interactions for Protein: A6NDI0

TRIM49B, Putative tripartite motif-containing protein 49B, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49BA6NDI0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM49BA6NDI0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms