Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VWA8A3KMH1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms