Protein–RNA interactions for Protein: A0A578

TCRBV5S1A1T, T-cell receptor beta variable 5-1 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S1A1TA0A578 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCRBV5S1A1TA0A578 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCRBV5S1A1TA0A578 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
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TCRBV5S1A1TA0A578 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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