Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQF3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms