Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 ZFYVE26-207ENST00000555452 7309 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 NANOGP1-202ENST00000607111 1982 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 TNFSF11-204ENST00000405262 2135 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 C17orf80-205ENST00000535032 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 SUMO2-202ENST00000420826 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 MRPL19-202ENST00000393909 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 FIGNL1-206ENST00000433017 3626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 MYO5A-205ENST00000399231 12225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 ST8SIA3-201ENST00000324000 11833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 MEIS1-212ENST00000495021 2836 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 ECD-203ENST00000430082 2246 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC074043.1-201ENST00000483126 1776 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 TNFAIP3-210ENST00000620204 3817 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 NHLRC3-202ENST00000379600 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 KCNE1-208ENST00000611936 3222 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 ZNF43-202ENST00000357491 5249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AL354984.1-201ENST00000371169 1854 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 RPS3-214ENST00000530164 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 LINC00705-201ENST00000417883 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 CNTNAP4-201ENST00000307431 4867 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 CNTNAP4-207ENST00000611870 4867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 TTLL5-201ENST00000286650 1595 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AL365217.1-201ENST00000398578 2436 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 CALCOCO2-203ENST00000416445 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 MELK-206ENST00000536329 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 MTMR3-202ENST00000333027 8906 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 CLEC4C-201ENST00000354629 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 RNU4-8P-201ENST00000364936 141 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 LDHAP7-201ENST00000398295 965 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 ADAM10-203ENST00000402627 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 RIMKLBP1-201ENST00000408914 1164 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 VAMP8-202ENST00000409760 805 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AL592486.1-201ENST00000418343 1220 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 RFTN1P1-201ENST00000442584 1033 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AF111169.1-201ENST00000469811 374 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 LINC00881-202ENST00000471719 791 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 RN7SL535P-201ENST00000479087 296 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 KRT18P59-201ENST00000524879 1231 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 PHBP19-201ENST00000547512 754 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AL132777.1-201ENST00000556153 618 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC044798.2-201ENST00000564222 1235 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 FXYD1-206ENST00000588715 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC008687.3-201ENST00000599209 598 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC092175.1-201ENST00000605325 200 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC087284.1-201ENST00000614119 1049 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 STRADA-224ENST00000617949 705 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AL512638.3-201ENST00000620370 298 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 SORBS1-201ENST00000277982 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 METTL2B-204ENST00000480046 5743 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 HECTD4-202ENST00000377560 15759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 WDR31-201ENST00000341761 4862 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 WDR31-202ENST00000374193 4878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 SLC7A3-201ENST00000298085 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 BRPF3-211ENST00000534400 4254 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 TECPR2-203ENST00000558678 4281 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 KNOP1P5-201ENST00000358374 1378 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 DEPDC5-201ENST00000382111 5212 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 PKP4-201ENST00000389757 5777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 CSF2RA-209ENST00000432318 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 TMPPE-201ENST00000342462 3962 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 EYA1-204ENST00000388741 3404 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 SYT6-202ENST00000607941 4352 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 ZSCAN23-201ENST00000289788 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 SLC17A6-201ENST00000263160 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 OSBPL6-204ENST00000359685 7114 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 C11orf45-201ENST00000310799 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 PRRC2C-204ENST00000426496 10175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 DAZL-202ENST00000399444 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 CSGALNACT1-201ENST00000332246 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 FAM107B-206ENST00000378470 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 EHBP1-201ENST00000263991 5165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 BLNK-202ENST00000371176 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 UBLCP1-201ENST00000296786 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 GUCY1B3-203ENST00000503520 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 FAM13C-214ENST00000611933 3033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 ATL1-201ENST00000358385 2647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 Z95114.2-201ENST00000623490 2205 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AKR1C3-201ENST00000380554 1807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 SCMH1-204ENST00000361705 3115 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 RBBP6-201ENST00000319715 6229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 B4GALT6-202ENST00000306851 3891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 CUL4A-212ENST00000617546 5666 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 HSPA8P8-201ENST00000419827 1942 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 OTOF-205ENST00000403946 6937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 NUP43-203ENST00000367404 1089 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 SPRR2D-204ENST00000368758 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 RPS6-202ENST00000380381 892 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 RNVU1-7-201ENST00000383858 164 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 HIST1H1PS1-201ENST00000404269 574 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 KCNIP1-204ENST00000411494 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC068051.1-201ENST00000412896 442 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 CABYR-205ENST00000415309 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 UBE2E1-203ENST00000424381 1224 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 UGT1A13P-201ENST00000424780 762 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 SMYD3-IT1-201ENST00000426929 361 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AL009172.1-201ENST00000436365 1098 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC068051.1-202ENST00000437883 543 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC104088.1-201ENST00000445613 510 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 UBE2E1-206ENST00000467766 585 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 RN7SL586P-201ENST00000479137 296 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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