Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 U62317.5-201ENST00000609268 362 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 MIR7847-201ENST00000610912 103 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC138894.4-201ENST00000616703 256 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 ST7-OT3_2.1-201ENST00000617884 137 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 SMIM2-AS1-203ENST00000618753 2101 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 Metazoa_SRP.190-201ENST00000620330 287 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 LINC01002-213ENST00000632086 918 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 KF456110.1-201ENST00000641105 385 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AGAP1-212ENST00000614409 9932 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 TECPR2-201ENST00000359520 8686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 RPA1-201ENST00000254719 4340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AL132780.5-201ENST00000623843 1625 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC118344.2-201ENST00000622968 4765 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 PUS7L-202ENST00000416848 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 SNX19P2-201ENST00000452841 2971 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 SMAP2-206ENST00000614549 2570 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 KCND2-201ENST00000331113 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 NOP2-202ENST00000382421 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 ZNF155-209ENST00000611002 2732 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 ZNF772-201ENST00000343280 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 KIAA1217-208ENST00000396446 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 USP30-203ENST00000392784 2483 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 WDR20-206ENST00000454394 2067 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 NTN4-202ENST00000344911 3152 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 TBC1D3P1-DHX40P1-201ENST00000587125 1841 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 HSPB11-203ENST00000371377 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 ATP5G3-203ENST00000409194 795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 RN7SKP3-201ENST00000411409 358 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 SOX9-AS1-201ENST00000412640 635 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AL390835.1-201ENST00000413941 901 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 LINC01090-201ENST00000415357 881 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 BX293535.1-201ENST00000443579 283 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AL592546.1-201ENST00000448834 692 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 LINC01504-203ENST00000451596 671 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC106820.1-201ENST00000468708 420 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AL451124.1-201ENST00000478520 1026 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 RN7SL242P-201ENST00000491451 297 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 STMN2-202ENST00000518111 799 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AP003385.4-201ENST00000524977 324 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC018410.1-202ENST00000545474 492 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 FAM174B-204ENST00000555064 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC060766.4-201ENST00000592117 537 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 SQSTM1P1-201ENST00000603451 859 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AL138999.1-201ENST00000612824 501 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC018554.3-201ENST00000614215 1026 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AL354751.3-201ENST00000618526 1027 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AL662791.5-202ENST00000623946 461 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC010507.2-201ENST00000632795 676 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 TUBA1C-210ENST00000639419 1075 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 RBFOX1-201ENST00000311745 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 LINC02363-201ENST00000317596 2153 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 ATL1-202ENST00000441560 2853 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 SLC38A1-201ENST00000398637 8066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 WNT2B-201ENST00000256640 2819 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 RPLP0P2-206ENST00000496593 3525 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC104472.1-201ENST00000399242 1585 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 B2M-204ENST00000558401 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 FBXW12-202ENST00000415155 1370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC009403.1-202ENST00000460022 1356 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 GNE-206ENST00000543356 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 CA5B-204ENST00000454127 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 PLEC-206ENST00000357649 14689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 TRIM9-203ENST00000360392 3726 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 NIF3L1-202ENST00000409020 1680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 MOCOS-201ENST00000261326 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 ACTA2-201ENST00000224784 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC026765.2-201ENST00000551875 1330 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 FGB-201ENST00000302068 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 ASXL2-202ENST00000404843 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 CALCOCO1-201ENST00000262059 5866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 ASTN2-204ENST00000358637 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 FGF1-204ENST00000378046 2582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 KLHL15-201ENST00000328046 6272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 NRXN3-215ENST00000557594 3381 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 EIF3K-201ENST00000248342 864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 NOVA1-201ENST00000344429 896 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 RAET1E-202ENST00000367363 817 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AL596223.2-201ENST00000413220 434 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AL365226.2-201ENST00000418403 397 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AKR1B1P4-201ENST00000426552 922 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 MRPL21-202ENST00000450904 662 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 ENPP7P4-201ENST00000487446 1086 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 LINC00498-201ENST00000504369 455 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AK4P2-201ENST00000504372 670 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 LINC02499-203ENST00000508147 455 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 ALDH1L1-AS1-201ENST00000512384 437 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC233724.2-201ENST00000515727 271 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 OR5BB1P-201ENST00000528843 939 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 MORN5-205ENST00000536616 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 RAD52-218ENST00000545564 681 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC073863.1-201ENST00000550206 570 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC009060.2-201ENST00000569264 106 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 IGFL1P2-201ENST00000593820 330 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC016629.3-202ENST00000596427 890 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC007216.5-201ENST00000612457 109 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC138932.4-201ENST00000619102 109 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 AC138969.4-201ENST00000620593 109 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LMO3Q8TAP4 OXNAD1-201ENST00000285083 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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