Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQE9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQE9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQE9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQE9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQE9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQE9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQE9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQE9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQE9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQE9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQE9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQE9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQE9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQE9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQE9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQE9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQE9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQE9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQE9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQE9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQE9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQE9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQE9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQE9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQE9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQE9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQE9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQE9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQE9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQE9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQE9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQE9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQE9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQE9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQE9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQE9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQE9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQE9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQE9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQE9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQE9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQE9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQE9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQE9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQE9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQE9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQE9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQE9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQE9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQE9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQE9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQE9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQE9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQE9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQE9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQE9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQE9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQE9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQE9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQE9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQE9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQE9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQE9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQE9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQE9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQE9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQE9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQE9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQE9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQE9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQE9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQE9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQE9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQE9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQE9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQE9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQE9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQE9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQE9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQE9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQE9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQE9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQE9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQE9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQE9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQE9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQE9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQE9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQE9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQE9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQE9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQE9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQE9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQE9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQE9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQE9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQE9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQE9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQE9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms