Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms