Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N1

COX11, Cytochrome c oxidase assembly protein COX11, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX11Q9Y6N1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COX11Q9Y6N1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms