Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GJA3Q9Y6H8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms