Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C2

EMILIN1, EMILIN-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN1Q9Y6C2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EMILIN1Q9Y6C2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EMILIN1Q9Y6C2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EMILIN1Q9Y6C2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EMILIN1Q9Y6C2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EMILIN1Q9Y6C2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EMILIN1Q9Y6C2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EMILIN1Q9Y6C2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EMILIN1Q9Y6C2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EMILIN1Q9Y6C2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EMILIN1Q9Y6C2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EMILIN1Q9Y6C2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
EMILIN1Q9Y6C2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
EMILIN1Q9Y6C2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
EMILIN1Q9Y6C2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
EMILIN1Q9Y6C2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
EMILIN1Q9Y6C2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EMILIN1Q9Y6C2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EMILIN1Q9Y6C2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EMILIN1Q9Y6C2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EMILIN1Q9Y6C2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EMILIN1Q9Y6C2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EMILIN1Q9Y6C2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EMILIN1Q9Y6C2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EMILIN1Q9Y6C2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EMILIN1Q9Y6C2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EMILIN1Q9Y6C2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EMILIN1Q9Y6C2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
EMILIN1Q9Y6C2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EMILIN1Q9Y6C2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EMILIN1Q9Y6C2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
EMILIN1Q9Y6C2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EMILIN1Q9Y6C2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
EMILIN1Q9Y6C2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EMILIN1Q9Y6C2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms