Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A2

CYP46A1, Cholesterol 24-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP46A1Q9Y6A2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP46A1Q9Y6A2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms