Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RAD54BQ9Y620 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms