Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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SNX13Q9Y5W8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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SNX13Q9Y5W8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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SNX13Q9Y5W8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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SNX13Q9Y5W8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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SNX13Q9Y5W8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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SNX13Q9Y5W8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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SNX13Q9Y5W8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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SNX13Q9Y5W8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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SNX13Q9Y5W8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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SNX13Q9Y5W8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNX13Q9Y5W8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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SNX13Q9Y5W8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
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SNX13Q9Y5W8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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SNX13Q9Y5W8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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SNX13Q9Y5W8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SNX13Q9Y5W8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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