Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms