Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNPO3Q9Y5L0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms