Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCDHB2Q9Y5E7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB2Q9Y5E7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms