Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX24Q9Y343 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms