Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LEMD3Q9Y2U8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LEMD3Q9Y2U8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LEMD3Q9Y2U8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LEMD3Q9Y2U8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LEMD3Q9Y2U8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LEMD3Q9Y2U8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LEMD3Q9Y2U8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LEMD3Q9Y2U8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LEMD3Q9Y2U8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LEMD3Q9Y2U8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LEMD3Q9Y2U8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LEMD3Q9Y2U8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LEMD3Q9Y2U8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LEMD3Q9Y2U8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LEMD3Q9Y2U8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LEMD3Q9Y2U8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LEMD3Q9Y2U8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LEMD3Q9Y2U8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LEMD3Q9Y2U8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LEMD3Q9Y2U8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LEMD3Q9Y2U8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LEMD3Q9Y2U8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LEMD3Q9Y2U8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LEMD3Q9Y2U8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LEMD3Q9Y2U8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms