Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms